游击战争作为一种特殊玩法，主要通过游击军机制实现。游击军的特点是脱离同盟束缚，以掠夺资源、快速征兵和灵活机动为核心，适合偏好独立作战或小规模突袭的玩家。游戏为游击军提供了专属加成，例如建造营帐速度提升和征兵加速，使其能够以战养战，但同时也限制了其与正规军的互动，例如无法加入同盟且只能与非游击军玩家交战。这种设计既保留了游击战的自由度，又避免了游戏平衡被破坏。
游击军的核心优势在于资源掠夺效率。通过占领其他玩家的土地或攻陷城池，游击军可以快速积累资源，尤其适合活跃度高、擅长战术调度的玩家。游戏中的军势系统进一步放大了这一优势，加入军势后，掠夺行为能为整个群体带来额外资源收益。游击军的劣势同样明显，例如无法享受同盟的集体保护，且赛季奖励与正规军存在差异，长期依赖游击玩法可能导致后期发展受限。
从战术层面看，游击军需要注重兵种搭配和战法选择。由于无法依赖同盟支援，队伍配置需兼顾输出与生存能力。盛气凌敌、卧薪尝胆等控制类战法可提升容错率，而高速嘲讽类武将能有效扰乱敌方节奏。游击军的战斗风格更倾向于避实击虚，优先攻击资源密集但防御薄弱的目标，避免与主力部队正面冲突。这种打法对玩家的战场洞察力和时机把握要求较高。
游击战争的适用性还取决于赛季阶段和服务器环境。在赛季初期，玩家普遍处于开荒阶段，资源分布分散，游击军更容易找到突破口；而赛季中后期，随着正规军形成防线，游击军的活动空间会被压缩。服务器内同盟的活跃度和组织度也会影响游击战效果，在松散管理的服务器中，游击军的威胁性显著提升。
三国志战略版的游击战争玩法设计较为完善，既还原了历史上游击战的灵活性，又通过机制限制避免了滥用。玩家选择这一玩法时需明确其高风险高回报的特性，并做好长期资源规划和战术调整。对于喜欢独立作战或追求刺激的玩家，游击军无疑提供了独特的游戏体验，但若更倾向于团队协作与稳定发展，正规军仍是更稳妥的选择。
